Alkali fosfatase berperan dalam proses pemecahan fosfat dari berbagai molekul yang penting untuk berbagai proses biokimia, termasuk metabolisme tulang dan pencernaan. Enzim alkali fosfatase banyak ditemukan pada sitosol dari sel hati dan membran kanalikular hepatosit. Konsentrasinya menurun pada organ lain seperti plasenta, ginjal, dan tulang.
Pemeriksaan alkali fosfatase dapat digunakan untuk menilai kesehatan hati, tulang, dan saluran empedu. Peningkatan alkali fosfatase dapat terjadi pada pasien dengan gangguan saluran empedu dan pasien dengan penyakit sistem rangka. Peningkatan aktivitas alkali fosfatase dapat terlihat signifikan pada anak-anak dan remaja dikarenakan peningkatan aktivitas osteoblas setelah pertumbuhan tulang yang dipercepat.