Apolipoprotein A1 (Apo A1) merupakan protein utama yang terdapat pada high-density lipoprotein (HDL). Apo A1 berperan dalam metabolisme lipid dan transport kolesterol dari jaringan ke hati untuk dieliminasi. Sama halnya dengan kolesterol HDL, tingginya konsentrasi Apo A1 juga dikaitkan dengan rendahnya resiko penyakit kardiovaskular.
Konsentrasi Apo A1 yang rendah tetapi konsentrasi HDL normal dapat digunakan sebagai tindakan prediktif terhadap aterosklerosis praklinis. Sedangkan konsentrasi Apo A1 yang meningkat tetapi HDL normal dapat dikaitkan dengan penurunan resiko kardiovaskular pada pasien dengan pengobatan statin.Pemeriksaan Apo A1 dengan konsentrasi sangat rendah juga dapat digunakan untuk membantu deteksi kelainan genetik seperti penyakit Tangier.