Anti-HBe merupakan antibodi spesifik terhadap HBeAg. Pemeriksaan anti-Hbe, bersama dengan HBeAg dan HBV DNA, digunakan untuk memantau perjalanan penyakit pada infeksi HBV akut ataupun kronis, menentukan status infeksi HBV kronis, serta memantau respon terapi antiviral. Serokonversi HBeAg menjadi anti-HBe mengindikasikan berakhirnya replikasi virus yang berasosiasi dengan kesembuhan pasien.
Pada infeksi HBV akut, HBeAg dapat segera terdeteksi setelah HBsAg dan menghilang sebelum HBsAg yang diikuti dengan kemunculan anti-HBe.